A Secretaria Nacional de Assuntos Institucionais é a responsável pela relação entre o partido e suas experiências administrativas e legislativas no âmbito dos poderes Executivo e Legislativo. A SNAI também serve como referência para a articulação da intervenção do PT no Movimento Municipalista, esfera institucional que adquire cada vez maior relevância no debate sobre o Pacto Federativo. Por fim, a SNAI atua conjuntamente com a Fundação Perseu Abramo para atualizar permanentemente os elementos que caracterizam o Modo Petista de Governar e Legislar.